الوحدة الثانية : العلاقة بين بنية و وظيفة البروتين .
النشاط الاول: تمثيل البنية الفراغية للبروتين .
**ﺘﺄﺨﺫ ﺍﻟﺒﺭﻭﺘﻴﻨﺎﺕ ﺒﻌﺩ ﺘﺭﻜﻴﺒﻬﺎ ﻋﻠﻰ ﻤﺴﺘﻭﻯ ﺍﻟﺭﻴﺒﻭﺯﻭﻤﺎﺕ ﺒﻨﻴﺎﺕ ﻓﺭﺍﻏﻴﺔ ﻤﺤﺩﺩﺓ ﻭﻤﻌﻘﺩﺓ، ﻟﻴﺘﻡ ﺒﻌﺩﻫﺎ ﺘﻭﺠﻴـﻪ
ﻫﺫﻩ ﺍﻟﺒﺭﻭﺘﻴﻨﺎﺕ ﻨﺤﻭ ﺍﻟﻤﻜﺎﻥ ﺍﻟﺫﻱ ﺘﺅﺩﻱ ﻓﻴﻪ ﻭﻅﻴﻔﺘﻬﺎ ﺍﻟﻤﺤﺩﺩﺓ ﺩﺍﺨل ﺃﻭ ﺨﺎﺭﺝ ﺍﻟﺨﻠﻴﺔ.
I. ﺘﻤﺜﻴل ﺍﻟﺒﻨﻴﺔ ﺍﻟﻔﺭﺍﻏﻴﺔ ﻟﻠﺒﺭﻭﺘﻴﻨﺎﺕ:
1.ﺘﻤﺜﻴل ﺍﻟﺒﻨﻴﺔ ﺍﻟﻔﺭﺍﻏﻴﺔ ﻟﻠﺠﺯﻴﺌﺎﺕ ﺍﻟﺒﺴﻴﻁﺔ:
ﻴﻤﻜﻥ ﺘﻤﺜﻴل ﺍﻟﺒﻨﻴﺔ ﺍﻟﻔﺭﺍﻏﻴﺔ ﻟﺠﺯﻱﺀ ﺒﺴﻴﻁ ﻤﺜل ﺤﻤﺽ ﺃﻤﻴﻨﻲ ﺒﻌﺩﺓ ﻁﺭﻕ (ﻨﻤﺎﺫﺝ)، ﻤﻨﻬـﺎ
* ﻨﻤـﻭﺫﺝ ﺍﻟﻌـﻭﺩ (bâtonnet)
* ﻨﻤﻭﺫﺝ ﺍﻟﻜﺭﺍﺕ ﻭﺍﻟﻌﻭﺩ (boules et bâtonnets)
*ﺍﻟﻨﻤﻭﺫﺝ ﺍﻟﻤﻜﺩﺱ (sphères).
ﻭﻟﻘﺩ ﺴﻤﺢ ﺍﻟﺘﻘﺩﻡ ﺍﻟﻌﻠﻤﻲ ﻭﺍﻟﺘﻜﻨﻭﻟﻭﺠﻲ ﺒﺭﺅﻴﺔ ﻫﺫﺍ ﺍﻟﺘﻤﺜﻴل ﻋﻠﻰ ﺸﺎﺸﺔ ﺍﻟﻜﻤﺒﻴﻭﺘﺭ ﺒﺎﺴﺘﻌﻤﺎل ﺒﺭﺍﻤﺞ ﻤﺤﺎﻜﺎﺓ ﺨﺎﺼﺔ (ﺍﻟﻭﺜﻴﻘﺔ 1 ﺹ 40 ﻤﻥ ﺍﻟﻜﺘﺎﺏ ﺍﻟﻤﺩﺭﺴﻲ).
2.ﺘﻤﺜﻴل ﺍﻟﺒﻨﻴﺔ ﺍﻟﻔﺭﺍﻏﻴﺔ ﻟﻠﺠﺯﻴﺌﺎﺕ ﺍﻟﻜﺒﻴﺭﺓ: (ﺍﻟﻭﺜﻴﻘﺔ 2 ﺹ 41).
ﻴﺤﺘﺎﺝ ﺘﻤﺜﻴل ﺍﻟﺒﻨﻴﺔ ﺍﻟﻔﺭﺍﻏﻴﺔ ﻟﻠﺠﺯﻴﺌﺎﺕ ﺍﻟﻜﺒﻴﺭﺓ، ﻤﺜل ﺍﻟﺒﺭﻭﺘﻴﻥ، ﺇﻟﻰ ﻨﻔﺱ ﺍﻟﻨﻤﺎﺫﺝ ﺍﻟﻤﺫﻜﻭﺭﺓ ﺴﺎﺒﻘﺎ ﺒﺎﻹﻀﺎﻓﺔ
ﺇﻟﻰ ﻨﻤﺎﺫﺝ ﺃﺨﺭﻯ ﺃﻜﺜﺭ ﻓﺎﺌﺩﺓ ﻓﻲ ﺘﻭﻀﻴﺢ ﺠﻭﺍﻨﺏ ﻤﻥ ﻫﺫﻩ ﺍﻟﺒﻨﻴﺔ ﺍﻟﻔﺭﺍﻏﻴﺔ ﻤﺜل ﺍﻟﺒﻨﻴﺎﺕ ﺍﻟﺜﺎﻨﻭﻴﺔ الفا ﻭبيتا ﻭﻤﻨﺎﻁﻕ ﺍﻻﻨﻌﻁﺎﻑ بحث مناطق الانعطاف هي مناطق التي لا تاخذ البنية الثانوية الفا و لا بيتا .